2. 制做膠室（三種方法）：
1.) 密封條密封：先將平凹兩塊玻璃板合在一起,用密封條；（1mm 膠板用空心塑料管；1.5mm 膠板用實心硅膠條），從右上角沿玻璃條外側嵌入,放好一側后,左手捏住兩塊玻璃
,右手用夾子夾住玻璃的右上端.然后再把密封條嵌入下端和左側.(如不好放可用相應厚度的試樣格輕輕推入) 密封條嵌好后,玻璃板的兩側分別用兩個夾子夾好，下端的兩個夾子可直接立在實驗臺上,也可與膠室支架夾在一起。膠凝結后，再去掉膠條;2.) 凡士林密封：把帶有玻璃條的玻璃板平放在試驗臺上，用 10ml 注射器沿玻璃板三邊涂上凡士林。玻璃條處少涂，下端多涂，下端凡士林線條要高于玻璃條。再把凹玻璃板放在上面，這樣就成為一個膠室。將膠室立于膠室支架的活動長柱上，沿玻璃條正中夾好鐵夾，以凹口邊線為基準，向下在玻璃板上標出灌膠高度記號。電泳時注意把下端凡士林去掉;
3.) 瓊脂槽密封：先將瓊脂密封槽放入
電泳槽中.將平玻璃板的玻璃條處涂上少許凡士林，然后與凹玻璃合在一起，玻璃板下端放入瓊脂槽中，并用夾子與
電泳槽的主板一起夾好。把配好的瓊脂糖溶液倒入瓊脂密封槽中。待瓊脂糖溶液聚合后，既可灌膠。
3. 灌膠：
1.) 灌分離膠：灌膠前再次檢查密封情況，用左手將膠室支架傾斜拿著，右手將抽氣三角瓶內的溶液沿凹玻璃板口灌**標記高度處，根據灌膠水平記號將膠室支架墊平，沿凹玻璃板口面小心地覆蓋一層抽氣后的重蒸水待凝;
2.) 灌濃縮膠：待分離膠聚合后，抽去覆蓋水，用少許濃縮膠溶液沖洗分離膠面，灌濃縮膠溶液**凹玻璃口3mm 處，插進試樣格（梳子）待凝;3.) 灌淀粉膠和瓊脂糖膠：將淀粉和瓊脂糖用緩沖液配成所需濃度的溶液，煮**透明，于50℃～60℃從凹口正中灌入膠室，立即放上試樣格;
4. 撥出試樣格：撥出試樣格前，先輕輕搖動，然后小心撥出，如加樣槽不正，可用長針頭扶正;
5. 裝膠室：如采用
1、2 兩種制膠方法，膠室放入電泳槽時下端應傾斜一定角度，以便趕走氣泡。將膠室凹玻璃板緊靠電泳槽立板的凹口處，并與立板上的密封條接觸，并夾緊鐵夾，（如做一塊膠，另一邊需用方玻璃板擋上），在玻璃板試樣格底端位置上作上記號，便于加樣時識別位置;
6. 排氣泡：上下槽各加滿預冷電泳液，用9 號獸用長針頭（磨平針尖）彎成“J”形，抽凈槽底膠面的氣泡，接通電源（上負下正）預電泳;
7. 加樣：用取液器吸取30μl～50μl 樣品溶液插入樣品槽底部，慢慢注入樣品（樣品含甘油或蔗糖），逐漸排除樣品槽中的電泳液;
8. 加掛冰槽：加樣后為防止漂樣，需在室溫下原地不動電泳一小時，才能將電泳槽移入冰箱，當室溫過高時，可將冰塊裝入掛冰槽，掛在方玻璃板上降溫，冰塊要放均勻，以免影響遷移率;
9. 電泳：先使上槽電極與
電泳儀的負極相連，下槽電極與
電泳儀的正極相連，檢查無誤后接通電泳儀即可電泳。電泳過程中禁止人體與電泳槽接觸;
10.結束電泳：電泳實驗結束后，先關掉電泳儀，然后拔掉電源導線，吸出上下槽內的緩沖液（分別保存、可重復使用），松開夾子，取下膠室，去掉凹玻璃板和板條。用刀片沿濃縮膠和分離膠界面切開一條線，去掉濃縮膠，將分離膠進行染色、脫色等后續處理。
